Nakon skoro decenije rada u advokaturi, Mirjana Popović je krajem 2010. godine izabrana za sutkinju Osnovnog suda u Podgorici. Njen mandat na ovoj poziciji obilježio je proces koji je vođen protiv dnevnih novina „Dan“ a po tužbi Ane Đukanović, sestre Mila Đukanovića, sve zbog tekstova ovog lista u vezi sa aferom „Telekom“, ali i kontratužbi tog medija protiv Đukanović. Popović je objedinila taj proces i u oktobru 2013. godine odbila i tužbu Đukanović i protivtužbu „Dana“.
Za vrijeme obavljanja funkcije Višeg suda u Podgorici bila je i jedan od kandidata za sudiju Evropskog suda za ljudska prava. 2022. godine konkurisala je i za jedno od upražnjenih mjesta sudija Ustavnog suda Crne Gore. Ipak, u januaru 2023. godine Sudski savjet izabrao ju je za sutkinju Apelacionog suda Crne Gore. U konačnom, u aprilu 2024. ove godine imenovana je za predsjednicu Apelacionog suda Crne Gore.