Sanja Jovićević položila je zakletvu kao zamjenik osnovnog državnog tužioca u Podgorici u martu 2004. godine. U toku 2009. godine bila je u fokusu javnosti kao zastupnik optužnice protiv šestorice pripadnika Uprave policije osumnjičenih za prebijanje pok. Aleksandra Pejanovića, bivšeg bokserskog reprezentativca. U istom periodu odbacila je krivičnu prijavu koju je protiv bivšeg gradonačelnika Podgorice, Miomira Mugoše, podnijela kompanija „Daily Press“ (izdavač Vijesti), a zbog incidenta između Mugoše i njegovog sina sa jedne, i Mihaila Jovovića i Borisa Pejovića iz Vijesti sa druge strane. Jovićević je optužnicom teretila mlađeg Mugošu da je povrijedio urednika Vijesti u pomenutom incidentu.
2010. godine napredovala je u Više državno tužilaštvo u Podgorici, a potom vodila istrage i zastupala optužnice u slučajevima ubistava i trgovine drogom, najčešće. Bila je zastupnik optužnice i u ponovljenom suđenju za ubistvo urednika „Dana“ Duška Jovanovića, u kom postupku je Damir Mandić zbog saizvršilaštva u istom osuđen na 19 godina zatvora.
Po osnivanju Specijalnog državnog tužilaštva Crne Gore bila je jedna od prvih specijalnih tužilaca koji su izabrani, ljeta 2015. godine. Funkcija u pravosudnom sistemu Crne Gore opet joj je ukrstila puteve sa Miomirom Mugošom, protiv koga je podigla optužnicu zbog navodnih zloupotreba u slučaju prodaje opštinskog zemljišta kompaniji „Carine“. U ovom slučaju Viši sud u Podgorici pravosnažno je oslobodio Mugošu optužbi za zloupotrebu službenog položaja.
U avgustu 2021. godine izabrana je za članicu Tužilačkog savjeta, a ostavku u tom tijelu podnijela je krajem 2023. godine da bi, kako su tada pisali mediji, mogla preći u Vrhovno državno tužilaštvo.
Njeno postupanje problematizovano je kada je, na sjednici Odbora za politički sistem, pravosuđe i upravu Skupštine Crne Gore, saopšteno da je upravo ona odbacila krivičnu prijavu protiv Zorana Lazovića, bivšeg policijskog funkcionera, podnešenu zbog ukidanja zabrane ulaska u Crnu Goru za Veljka Belivuka i Marka Miljkovića. Jovićević je tada pojasnila da je tokom izviđaja saslušala više osoba, među kojima su bili službenici policije, MUP-a i Interpola Podgorica, te da je ocijenila da nema dokaza koji ukazuju na elemente krivičnog djela. Na tu odluku podnesena je i pritužba, ali je Vrhovno državno tužilaštvo odbacilo. Zbog ovoga je Jovićević i saslušana kao svjedok u postupku koje Specijalno državno tužilaštvo vodi protiv Zorana Lazovića i Milivoja Katnića, bivšeg glavnog specijalnog tužioca.
Zastupala je optužnicu i u predmetu „Telekom“, u kom su Oleg Obradović i Miodrag Ivanović oslobođeni optužbi za zloupotrebu položaja u privrednom poslovanju u februaru 2025.